Героями игры являются кальмары, способные атаковать врагов своими длинными щупальцами. Игра предлагает 15 кальмаров и 4 класса (целитель, топтун, стрелок и разведчик), из которых можно создать свою боевую группу. Приключения состоят из 90+ миссий, обещающих не менее 15 часов геймплея. Для усиления кальмаров в игре есть более 65 шлемов, обладающих разными бонусами к статам. Врагами кальмаров являются раки.
Squids Odyssey включает 2 кампании, ранее выходившие на ПК и смартфонах (эти кампании во многом подстроены и улучшены), а также новую кампанию в японском королевстве Вакамэ. Добавлен новый герой Октоку и 4 эксклюзивных шлема. Для Wii U полностью переработано управление: игрок может целиться и стрелять левым стиком, может переходить в управление через сенсорный экран Wii U GamePad. В версии для 3DS есть выбор между контрольными кнопками или стилусом, а геймплей отображается с 3D-эффектами.