Game Boy Wars 3 – третий и последний сиквел к Game Boy Wars. Рабочим названием игры было «Game Boy Wars Pocket Tactics». Игра сделана по модели серии военных симуляторов Nectaris, создателем которой является компания Hudson. Так, юниты с непрямыми атаками теперь могут в течение одной очереди и перемещаться, и атаковать. В отличие от предыдущих игр Game Boy Wars, наличия денег недостаточно для произведения определенных юнитов; Игрок должен также доставить в города и фабрики строительные материалы, а для этого нужно разместить строительных юнитов и изготовить материалы. Строительные юниты умеют срезать деревья и прокладывать дороги.
В игре есть режим Начинающего, дающий 16 уроков геймплея, и Стандартный режим, позволяющий сражаться с компьютером или с другим игроком. Стандартный режим включает 60 карт. Также наличествует Кампания с несколькими возможными сюжетными линиями. В кампании 45 карт. Только в Кампании игрок может передислоцировать выживших юнитов из предыдущей битвы. В бою юниты получают опыт, позволяющий повышаться до одного из пяти рангов: D, C, B, A и S. Юнит, достигший ранга S, превращается в юнита нового типа.
