Вторая часть серии Blair Witch основывается на истории, тесно связанной с первой частью и одноименным фильмом 1999 года. Главный герой – солдат Союза времен Американской гражданской войны, получивший смертельное боевое ранение и оставленный умирать. Потеряв сознание, он слышит загадочный голос: «Твое время еще не пришло, солдат. Я всё еще нуждаюсь в тебе!». Действительно, время солдата не пришло: его находит девушка Робин Вивер и доставляет в изолированный дом, где она живет со своей бабушкой Бесс.
В результате ряда галлюцинаций и предсмертного опыта солдат узнает, что Робин находится в опасности. Проснувшись, он проявляет признаки амнезии и не может вспомнить, кем является. Единственная наводка на прошлое – солдатская униформа. Поскольку солдат не может вспомнить свое имя, бабушка Робин, набожная христианка, временно называет его Лазарем.
Вскоре Бесс сообщает, что Робин пропала в лесу, и просит найти внучку. Она убеждена, что «лес взял ее». Солдат списывает это на паранойю женщины, считая, что Робин просто ушла играть в лес и немного увлеклась. Однако, Бесс настаивает на своем, и солдат нехотя соглашается помочь в поисках. По мере прохождения Лазарь раскрывает элементы своего прошлого, которые постепенно объясняют суть происходящих событий.
